More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4472 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  50.52 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  52.27 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  50.57 
 
 		 229 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  49.14 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  46.59 
 
 		 229 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  49.14 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  48 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  46.02 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  47.73 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  46.11 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  38.43 
 
 		 207 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  43.23 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  40.91 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  39.9 
 
 		 233 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  45.9 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  41.71 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  37.29 
 
 		 226 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  37.29 
 
 		 226 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  34.87 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  36.81 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  36.5 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  36.16 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  36.05 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  36.22 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  36.57 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  37.57 
 
 		 234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  38.07 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  36.26 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  36.53 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  30.96 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  34.62 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  34.1 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  32.8 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  36 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.29 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 220 aa  96.3  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 		 231 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  30.99 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  35.32 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  29.73 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  32.78 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.06 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  36.93 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 		 228 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  27.81 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  32 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  29.86 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  34.75 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  32.57 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  34.44 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  33.12 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  29.08 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  33.69 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  30.09 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  28.38 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  32.18 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  32.04 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.82 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  32.66 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  35.03 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  33.98 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  33.54 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  34.25 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  32.75 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  32.78 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  30.65 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  35.89 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.14 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  33.15 
 
 		 232 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.89 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.81 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  32.85 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>