More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1747 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 463 aa  894    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  35.93 
 
 		 1833 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 445 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  37.55 
 
 		 1816 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 449 aa  269  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 449 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.23 
 
 		 1829 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.29 
 
 		 1876 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.03 
 
 		 1839 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  33.41 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.35 
 
 		 1864 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.65 
 
 		 1806 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.25 
 
 		 2720 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.02 
 
 		 1769 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.37 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.62 
 
 		 1776 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 448 aa  193  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.65 
 
 		 927 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  32.65 
 
 		 927 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  30.64 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  27.06 
 
 		 397 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  27.32 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  31.85 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.86 
 
 		 422 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  26.19 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.58 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  26.96 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.32 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  26.96 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  26.05 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.32 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  26.05 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  24.68 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.26 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  27.03 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  23 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.84 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  23 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  24.17 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.74 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1196  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.897631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  24.25 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 		 134 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.46 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.94 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>