66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1196 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1196  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  901    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.897631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1431  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.96 
 
 		 1833 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.84 
 
 		 1864 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.98 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.41 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  23.54 
 
 		 1816 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.02 
 
 		 1876 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  26.64 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.26 
 
 		 1839 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.61 
 
 		 1829 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  24.38 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  17.75 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  25.74 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  24.01 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  20.4 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.47 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  26.73 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  19.7 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.57 
 
 		 1806 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  27.06 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  27.06 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2640  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  26.4 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  26.4 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  23.94 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  23.57 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>