44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1431 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1431  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 481 aa  929    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1196  major facilitator transporter  56.31 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.897631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.36 
 
 		 1833 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  21.55 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  27.58 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.98 
 
 		 1839 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  19.69 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.06 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  19.33 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.26 
 
 		 927 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.86 
 
 		 1864 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  23.06 
 
 		 1876 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  24.4 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  20.47 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  24.33 
 
 		 1816 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  28 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>