More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0939 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  48.74 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  48.74 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  47.46 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  47.46 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  46.61 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  44.63 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  46.72 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.19 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  45.76 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  45.69 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  44 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  43.97 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  47.97 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  45.76 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  45.08 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  46.09 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  43.7 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  44.92 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  43.1 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  45 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  44.07 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 227 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>