119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1489 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.57 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.26 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.32 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.43 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  37.04 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.51 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  37.39 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.25 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.21 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.45 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.04 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  53.49 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  34.51 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.27 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.61 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.51 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.51 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.56 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.23 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  28.46 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.71 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0766  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.02 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  38.46 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  31.73 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.41 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.37 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.48 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.52 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.52 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  41.79 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  35.79 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  30.56 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.37 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  37.18 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  33.67 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  32.65 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  32.65 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  32.65 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.02 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3414  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.65 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  hitchhiker  0.00103073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  39.02 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.53 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  40.24 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  38.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  33.73 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  33.73 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  22.86 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.27 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  34.15 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.02 
 
 		 100 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 125 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.23 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.418842 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  35.38 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  22.12 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.47 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  37.66 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  35.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.45 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.65 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>