291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0453 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
134 aa  257  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 
132 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.8 
 
 
130 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
156 aa  77.4  6e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 
156 aa  76.3  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 
156 aa  75.9  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
135 aa  72  3e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 
140 aa  70.9  5e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
140 aa  68.2  3e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 
137 aa  68.2  4e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
140 aa  67.4  6e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
140 aa  63.9  7e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1852  biopolymer transport exbD protein  31.54 
 
 
136 aa  63.5  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 
142 aa  62.8  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 
147 aa  61.6  3e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  32.81 
 
 
136 aa  60.1  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
141 aa  60.1  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  30.95 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.22 
 
 
142 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
133 aa  57.8  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.37 
 
 
136 aa  57.8  6e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.62 
 
 
136 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
149 aa  56.2  1e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 
143 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 
140 aa  55.8  2e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.7 
 
 
137 aa  55.8  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 
129 aa  55.8  2e-07  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  55.5  3e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
141 aa  55.5  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
158 aa  54.7  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  31.82 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 
136 aa  54.7  4e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 
142 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  25.36 
 
 
143 aa  54.3  6e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  27.69 
 
 
141 aa  54.3  6e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  32.95 
 
 
155 aa  53.9  8e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  33.62 
 
 
135 aa  53.5  9e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  32 
 
 
143 aa  52.8  1e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.45 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  25.4 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  30.17 
 
 
146 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.09 
 
 
139 aa  52.8  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  30.17 
 
 
146 aa  52  3e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 
148 aa  52  3e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
151 aa  51.6  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.33 
 
 
135 aa  51.6  4e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  23.97 
 
 
135 aa  51.2  4e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  34.09 
 
 
145 aa  51.2  4e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  30.77 
 
 
147 aa  51.2  5e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
151 aa  51.2  5e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 
132 aa  50.8  6e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.23 
 
 
145 aa  50.8  6e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.14 
 
 
131 aa  50.8  6e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
151 aa  50.4  8e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
142 aa  50.1  9e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
140 aa  50.4  9e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
135 aa  50.4  9e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 
136 aa  49.7  1e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
158 aa  50.1  1e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
140 aa  50.1  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.83 
 
 
136 aa  49.7  1e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  30.91 
 
 
153 aa  50.1  1e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
141 aa  49.7  1e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
142 aa  50.1  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
218 aa  49.7  2e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 
149 aa  49.7  2e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  25 
 
 
144 aa  49.3  2e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  31.82 
 
 
177 aa  49.3  2e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  27.5 
 
 
142 aa  48.9  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.03 
 
 
134 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  28.46 
 
 
141 aa  48.5  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
136 aa  48.9  3e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  29.51 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 
141 aa  48.1  4e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 
137 aa  48.1  4e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
158 aa  48.1  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 
143 aa  48.1  4e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
159 aa  48.1  4e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  26.89 
 
 
158 aa  47.8  5e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
137 aa  47.8  6e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
157 aa  47.4  7e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
146 aa  47.4  7e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  29.75 
 
 
154 aa  47.4  7e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  27.59 
 
 
132 aa  47.4  7e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  31.82 
 
 
145 aa  47  9e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
142 aa  47  9e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 
145 aa  47  9e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.69 
 
 
145 aa  47  9e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.41 
 
 
142 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.06 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  5.40401e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  21.74 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  27.27 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>