More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4958 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  100 
 
 		 192 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  63.59 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  63.59 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  61.41 
 
 		 185 aa  237  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.31 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.57 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>