More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2438 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
264 aa  533  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  62.02 
 
 
266 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  61.15 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 
264 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  54.33 
 
 
266 aa  244  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  53.94 
 
 
266 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
264 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
267 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 
265 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 
270 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
271 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
436 aa  231  8.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
267 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
269 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
268 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
277 aa  228  7e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
264 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 
283 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 
266 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
262 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
273 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 
290 aa  225  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
270 aa  224  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
272 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
270 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 
260 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
270 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
285 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
270 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
494 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
262 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
267 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
270 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
260 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
260 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 
271 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 
268 aa  215  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
497 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 
269 aa  211  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
308 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
276 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  51.19 
 
 
261 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
276 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
490 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
303 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  51.19 
 
 
261 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  49.58 
 
 
275 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
265 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
261 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
268 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 
297 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
285 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  55.81 
 
 
267 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
267 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
266 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  51.7 
 
 
301 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  53.15 
 
 
479 aa  208  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
269 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
267 aa  208  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
288 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
288 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 
297 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
268 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
303 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
288 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
268 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  52.38 
 
 
260 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
266 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
274 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
279 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
450 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>