28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2251 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 887 aa  1736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  61.07 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.86 
 
 		 659 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  28.45 
 
 		 847 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0646  hypothetical protein  40.3 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1193 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.58 
 
 		 684 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  38.85 
 
 		 537 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  36.23 
 
 		 872 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.43 
 
 		 1535 aa  87.8  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1514 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.87 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.87 
 
 		 1512 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  30.43 
 
 		 1000 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.54 
 
 		 1394 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  50.59 
 
 		 830 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  62.82 
 
 		 846 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  38.27 
 
 		 617 aa  54.7  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 261 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 		 914 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  37.5 
 
 		 551 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  25.4 
 
 		 411 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 356 aa  48.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  37.33 
 
 		 840 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  38.46 
 
 		 504 aa  47.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.98 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  49 
 
 		 453 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  44.83 
 
 		 735 aa  44.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>