46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0065 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  100 
 
 
502 aa  987  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  37.77 
 
 
497 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  35.6 
 
 
499 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  31.79 
 
 
1025 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  31.84 
 
 
459 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.13 
 
 
471 aa  71.6  3e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.88 
 
 
540 aa  59.7  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  5.61153e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  24.48 
 
 
475 aa  56.6  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  26.51 
 
 
425 aa  56.2  1e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  30.83 
 
 
531 aa  56.6  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.91 
 
 
470 aa  56.2  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.41 
 
 
474 aa  55.8  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  27.97 
 
 
438 aa  55.1  3e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.74 
 
 
461 aa  54.7  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  20.9 
 
 
428 aa  53.5  8e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.6 
 
 
467 aa  52.4  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  28.3 
 
 
494 aa  51.2  4e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  24.11 
 
 
467 aa  51.2  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  29.47 
 
 
773 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  27.33 
 
 
446 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  24.02 
 
 
404 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  22.97 
 
 
415 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  21.91 
 
 
404 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.56 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.3 
 
 
781 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.56 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  21.59 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  21.47 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  21.47 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  27.81 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  29.19 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  25.55 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.36 
 
 
607 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  30.97 
 
 
595 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  25.17 
 
 
449 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  28.24 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  27.21 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1303  hypothetical protein  30.91 
 
 
431 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.424505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  31.25 
 
 
444 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  22.3 
 
 
393 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  35.23 
 
 
443 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  29.05 
 
 
436 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.35 
 
 
500 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  21.5 
 
 
532 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  35.23 
 
 
443 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>