238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0481 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  72.22 
 
 		 226 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  68.84 
 
 		 228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  68.84 
 
 		 228 aa  318  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  66.82 
 
 		 226 aa  314  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  67.57 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  67.44 
 
 		 228 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  66.98 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  68.06 
 
 		 228 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  66.98 
 
 		 229 aa  307  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  66.98 
 
 		 229 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  67.59 
 
 		 228 aa  307  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  66.98 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  66.36 
 
 		 221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  66.98 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  67.59 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  66.51 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  62.84 
 
 		 224 aa  301  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  60.73 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  60.83 
 
 		 225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  60.37 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  57.99 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  59.07 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  58.9 
 
 		 222 aa  275  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  58.9 
 
 		 221 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 		 221 aa  274  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  58.06 
 
 		 221 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 		 221 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  60.55 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 		 261 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  57.99 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  56.68 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  57.34 
 
 		 232 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  57.34 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  59.09 
 
 		 229 aa  260  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  56.94 
 
 		 218 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  58.26 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  59.15 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  58.06 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 253 aa  257  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 		 235 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 		 231 aa  256  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 226 aa  249  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  55.2 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  55.2 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  55.2 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 		 240 aa  244  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 		 269 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  55.76 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  53.95 
 
 		 220 aa  241  9e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 		 301 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>