More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0270 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  100 
 
 		 151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  78.15 
 
 		 150 aa  235  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  68.53 
 
 		 243 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  63.27 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  64.79 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  67.36 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  65.31 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  64.58 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  63.51 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  64.79 
 
 		 164 aa  183  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  64.14 
 
 		 158 aa  183  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  64.34 
 
 		 210 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  62.76 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  61.33 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  64.54 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  62.94 
 
 		 177 aa  178  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  59.06 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  62.16 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  58.04 
 
 		 152 aa  169  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  60.42 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  60.42 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  61.54 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  58.74 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  58.28 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  55.94 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  57.64 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  56.03 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  57.34 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  50.98 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.03 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  50 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  43.15 
 
 		 174 aa  116  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.18 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  49.66 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  46.31 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  44.3 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  48.05 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  44.59 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  45.71 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.21 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  48.03 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  42.47 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  47.52 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>