More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3144 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  50.17 
 
 
276 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  47.57 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  50.85 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  62.86 
 
 
159 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  41.22 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  44.2 
 
 
183 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.19 
 
 
167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  38.52 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.96 
 
 
158 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.89 
 
 
170 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  36.73 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  39.72 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.44 
 
 
147 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.25 
 
 
165 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  42.74 
 
 
164 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.29 
 
 
168 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.33 
 
 
165 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  39.85 
 
 
158 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  34.67 
 
 
164 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40 
 
 
158 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.57 
 
 
164 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.5 
 
 
159 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40 
 
 
158 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  37.68 
 
 
165 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  34.56 
 
 
159 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.11 
 
 
145 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.58 
 
 
169 aa  99.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  36.62 
 
 
168 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 
165 aa  99  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
170 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.86 
 
 
163 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.71 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  36.99 
 
 
163 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  39.17 
 
 
165 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
158 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  39.73 
 
 
164 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.81 
 
 
165 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  36.76 
 
 
165 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  36.76 
 
 
165 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.09 
 
 
165 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.09 
 
 
165 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  35.21 
 
 
185 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  31.37 
 
 
183 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.82 
 
 
177 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.82 
 
 
177 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  37.96 
 
 
141 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  37.4 
 
 
166 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.58 
 
 
171 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  34.81 
 
 
163 aa  95.1  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  33.58 
 
 
171 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  32.64 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  34.56 
 
 
156 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  33.08 
 
 
154 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.58 
 
 
171 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.03 
 
 
163 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  31.94 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  36.03 
 
 
164 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  32.67 
 
 
163 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  35.14 
 
 
194 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  36.03 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 
158 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  35.14 
 
 
194 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  33.33 
 
 
154 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.03 
 
 
176 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  33.09 
 
 
178 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.56 
 
 
161 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  32.85 
 
 
174 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.21 
 
 
157 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  35.56 
 
 
160 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.14 
 
 
164 aa  92.8  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  31.97 
 
 
170 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  31.97 
 
 
164 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.78 
 
 
194 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  31.97 
 
 
164 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
175 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.97 
 
 
165 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  39.53 
 
 
141 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  32.85 
 
 
178 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  31.94 
 
 
164 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  32.12 
 
 
174 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 
167 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.57 
 
 
184 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  31.03 
 
 
169 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  33.81 
 
 
170 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 
167 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 
163 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 
167 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>