50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2545 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  846    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  59.95 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  61.18 
 
 		 411 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  56.31 
 
 		 1089 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  53.62 
 
 		 1232 aa  484  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  57.14 
 
 		 1032 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  56.42 
 
 		 1132 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  53.28 
 
 		 1050 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  54.57 
 
 		 1078 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  55.58 
 
 		 1075 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  51.94 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  52.44 
 
 		 1124 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  52.17 
 
 		 1062 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  52.2 
 
 		 1156 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  52.53 
 
 		 1161 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  52.9 
 
 		 1033 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  54.57 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  53.24 
 
 		 1089 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  51.94 
 
 		 1001 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  52.17 
 
 		 1067 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  54.96 
 
 		 1082 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  52.16 
 
 		 1027 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  51.72 
 
 		 414 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  52.04 
 
 		 1244 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  50.6 
 
 		 1127 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  49.06 
 
 		 1174 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  47.32 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  35.9 
 
 		 457 aa  245  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  34.46 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  32.17 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  32.28 
 
 		 380 aa  196  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  28.87 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  29.71 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  31.23 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  29.05 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  30.62 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  28.67 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  28.07 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  27.58 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  26.44 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  24.76 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  25.12 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  29.75 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1294  PHP domain protein  38.89 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>