More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1896 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000620774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  48.82 
 
 		 270 aa  245  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0033  hypothetical protein  30.54 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000645659  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 377 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  28.12 
 
 		 377 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  37.96 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  30.73 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  30.3 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.23 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  29.73 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.91 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  29.48 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  28.22 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  29.02 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  30.5 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  31.63 
 
 		 413 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  31.78 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  28.29 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  30.36 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  31.43 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  27.43 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 377 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  29.55 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  26.59 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  29.78 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.67 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  28.15 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  29.28 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  27.8 
 
 		 382 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  29.09 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  28.83 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  29.09 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  26.81 
 
 		 380 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  29.37 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  28.91 
 
 		 379 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  31.43 
 
 		 378 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  27.27 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.13 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.02 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  29.28 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  30.23 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  31.22 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  28.84 
 
 		 382 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  30.73 
 
 		 373 aa  98.6  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  29.33 
 
 		 382 aa  98.6  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  27.68 
 
 		 374 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  26.26 
 
 		 386 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  27.68 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  29.13 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  27.68 
 
 		 447 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.78 
 
 		 378 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  28.7 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  28.51 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  25.49 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  28.96 
 
 		 376 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  29.67 
 
 		 344 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  27.68 
 
 		 374 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  28.83 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  27.68 
 
 		 374 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  26.52 
 
 		 369 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  27.15 
 
 		 368 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.09 
 
 		 369 aa  95.5  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  27.69 
 
 		 385 aa  95.5  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  24.66 
 
 		 370 aa  95.5  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  27.73 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  25.78 
 
 		 376 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  30.7 
 
 		 394 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  28.71 
 
 		 376 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  29.49 
 
 		 384 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  27.45 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  30.31 
 
 		 379 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  25.65 
 
 		 369 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  29.9 
 
 		 216 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  30.94 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  30.3 
 
 		 377 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  28.87 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  29.85 
 
 		 377 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  29.8 
 
 		 377 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  28.24 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  30.35 
 
 		 383 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  26.46 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  29.26 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  28.89 
 
 		 377 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  28.89 
 
 		 377 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  29.69 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  27.47 
 
 		 394 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  28.44 
 
 		 377 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  29.44 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 355 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>