61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0797 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  100 
 
 		 1140 aa  2239    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  36.28 
 
 		 931 aa  272  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 2082 aa  207  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  30.46 
 
 		 614 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  50.3 
 
 		 1030 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  41.13 
 
 		 256 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  37.2 
 
 		 1567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  32.83 
 
 		 622 aa  127  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  33.84 
 
 		 3320 aa  124  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  32.18 
 
 		 386 aa  116  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  33.2 
 
 		 262 aa  112  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  25 
 
 		 660 aa  94.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  36.88 
 
 		 168 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.46 
 
 		 897 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  39.74 
 
 		 187 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  39.02 
 
 		 446 aa  90.1  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  31.63 
 
 		 661 aa  89.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  32.68 
 
 		 214 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4032  hypothetical protein  22.48 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.786838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  37.69 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.63 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  34.43 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  25 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  31.85 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  20.34 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  30.08 
 
 		 350 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.97 
 
 		 324 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.12 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.04 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.19 
 
 		 371 aa  60.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6472  hypothetical protein  27.31 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.78609 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  28.11 
 
 		 315 aa  56.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5720  hypothetical protein  27.31 
 
 		 501 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6926  hypothetical protein  24.16 
 
 		 502 aa  56.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  26.64 
 
 		 323 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.61 
 
 		 299 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  32.02 
 
 		 314 aa  51.6  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  24.73 
 
 		 545 aa  51.6  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.79 
 
 		 363 aa  51.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.02 
 
 		 365 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  28.47 
 
 		 354 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37430  BNR domain-containing protein  30.39 
 
 		 418 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  26.1 
 
 		 363 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  32.78 
 
 		 794 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  25.98 
 
 		 356 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  28.71 
 
 		 361 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  28.04 
 
 		 338 aa  48.5  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  35.24 
 
 		 665 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3134  hypothetical protein  25.82 
 
 		 511 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00000464771  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.84 
 
 		 321 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  28.83 
 
 		 546 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  25.59 
 
 		 382 aa  45.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1024 aa  45.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4281  hypothetical protein  30.95 
 
 		 409 aa  45.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  36.63 
 
 		 665 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.52 
 
 		 324 aa  45.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.26 
 
 		 325 aa  45.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28 
 
 		 313 aa  45.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  27.11 
 
 		 368 aa  44.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  32.37 
 
 		 368 aa  44.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>