More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3216 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 449 aa  902    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  78.01 
 
 		 414 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  79.34 
 
 		 415 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  75.63 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  74.09 
 
 		 431 aa  607  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  74.87 
 
 		 420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  75.13 
 
 		 411 aa  601  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  72.79 
 
 		 425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  74.87 
 
 		 420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  74.94 
 
 		 420 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  74.18 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  75.43 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  73.37 
 
 		 412 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  73.6 
 
 		 420 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  78.09 
 
 		 448 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  75.31 
 
 		 424 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  75.96 
 
 		 414 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  72.91 
 
 		 443 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  74.68 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  73.79 
 
 		 455 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  73.67 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  73.1 
 
 		 410 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  68.2 
 
 		 442 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  75.69 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  68.45 
 
 		 443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  69.01 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  72.28 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  73.28 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  73.52 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  73.16 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  69.02 
 
 		 418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  70.75 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  71.25 
 
 		 410 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  67.47 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  67.34 
 
 		 406 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  65.82 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.94 
 
 		 409 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  69.25 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 418 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  68.47 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  64.89 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  64.32 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  65.98 
 
 		 397 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 410 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  64.62 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  64.89 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  61.85 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.1 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  64.45 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.69 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  63.13 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>