291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0840 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
311 aa  597  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.49 
 
 
281 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.93 
 
 
292 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.08 
 
 
318 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.12 
 
 
290 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  41.58 
 
 
298 aa  180  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  43.1 
 
 
288 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.5 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
546 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  38.81 
 
 
291 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.14 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  38.89 
 
 
280 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  33.8 
 
 
300 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  39.22 
 
 
283 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  38.75 
 
 
280 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  39.74 
 
 
308 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.06 
 
 
295 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  34.15 
 
 
303 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  34.15 
 
 
300 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  38.11 
 
 
284 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  32.87 
 
 
288 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  33.22 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.27 
 
 
296 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  31.71 
 
 
300 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.03 
 
 
290 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.4 
 
 
285 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  32.53 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  37.92 
 
 
289 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  31.71 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.28 
 
 
293 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  36.99 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  37.59 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  36.9 
 
 
293 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.64 
 
 
293 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.92 
 
 
569 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  35.62 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.76 
 
 
287 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.61 
 
 
292 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.75 
 
 
280 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.58 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3944  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.16 
 
 
312 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.84 
 
 
292 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
315 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  37.5 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  35.96 
 
 
303 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.91 
 
 
286 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.88 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.42 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.79 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.36 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  35.79 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.01 
 
 
293 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  35.5 
 
 
309 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.17 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  33.86 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  35.84 
 
 
308 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  33.68 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.21 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0514  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.55 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.96 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.15 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.15 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  34.55 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.54 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.56 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  32.68 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.14 
 
 
296 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  33.45 
 
 
297 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  39.15 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
301 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  32.25 
 
 
395 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
301 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  33.8 
 
 
294 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  32.25 
 
 
395 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 
289 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.52 
 
 
302 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.51 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.82 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.4 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  34.24 
 
 
295 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.91 
 
 
302 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.47 
 
 
574 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.79 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.15 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0122  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.66 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271646  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  37.16 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  30.95 
 
 
279 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.52 
 
 
291 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.31 
 
 
292 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0125  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.56 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.64 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  35.91 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.13 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  32.13 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.79 
 
 
310 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.67 
 
 
574 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  30.84 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.67 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>