More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0471 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
154 aa  303  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  72.55 
 
 
152 aa  191  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  76.34 
 
 
154 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  68.79 
 
 
147 aa  186  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.09 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.32 
 
 
166 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  66.9 
 
 
176 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66.67 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  65.52 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.81 
 
 
165 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66.67 
 
 
144 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  70.83 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  77.52 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  77.52 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.43 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  77.52 
 
 
150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  61.74 
 
 
167 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  73.73 
 
 
152 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.58 
 
 
176 aa  166  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  61.97 
 
 
144 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.83 
 
 
158 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  67.41 
 
 
168 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.4 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.78 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.38 
 
 
159 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.4 
 
 
160 aa  157  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  61.38 
 
 
160 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  64.43 
 
 
150 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.42 
 
 
150 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.14 
 
 
154 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.69 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.38 
 
 
166 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.78 
 
 
143 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  64.58 
 
 
147 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.73 
 
 
185 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.32 
 
 
157 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.97 
 
 
144 aa  151  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  62.59 
 
 
190 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.78 
 
 
152 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.57 
 
 
176 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.92 
 
 
154 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  55 
 
 
171 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.47 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.7 
 
 
166 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
152 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  51.01 
 
 
150 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  68.07 
 
 
162 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  48.99 
 
 
149 aa  141  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 
157 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  48.03 
 
 
153 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  44.97 
 
 
160 aa  140  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.47 
 
 
151 aa  140  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.68 
 
 
156 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.68 
 
 
156 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.31 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.68 
 
 
165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  49.31 
 
 
159 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  51.43 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.22 
 
 
160 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.29 
 
 
179 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.61 
 
 
176 aa  137  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.39 
 
 
155 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  54.55 
 
 
177 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 
177 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.47 
 
 
142 aa  135  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  46.71 
 
 
165 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.71 
 
 
165 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2876  tRNA-adenosine deaminase  63.78 
 
 
167 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
156 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  52.7 
 
 
196 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  50.69 
 
 
146 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.66 
 
 
158 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.02 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  50.69 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
174 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  46.53 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  50.69 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.61 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.02 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.72 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.22 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.14 
 
 
147 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.66 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.31 
 
 
177 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.49 
 
 
178 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12760  tRNA-adenosine deaminase  52.32 
 
 
206 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255164  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.61 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.83 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.64 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.92 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  46 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.61 
 
 
166 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 
167 aa  128  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  48.61 
 
 
166 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>