More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0353 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 317 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.88 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.43 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  31.43 
 
 		 642 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.12 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 970 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.03 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  22.81 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  25.87 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 836 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  25.42 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  29.11 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.12 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.32 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  28.52 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 841 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 703 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 841 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.02 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  24.29 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.43 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.86 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  25.51 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 722 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.51 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>