131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1244 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  678  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  63.93 
 
 
297 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  47.26 
 
 
298 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.24724e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  39.45 
 
 
287 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  41.88 
 
 
290 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.11 
 
 
298 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.16 
 
 
283 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  36.78 
 
 
283 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  37.98 
 
 
285 aa  180  3e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  36.36 
 
 
289 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  35.11 
 
 
297 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  38.95 
 
 
282 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  39.25 
 
 
282 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.22 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  30.61 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  28.16 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  30.2 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  27.87 
 
 
317 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  27.53 
 
 
317 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  29.48 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  28.1 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  26.67 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  27.5 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  27.12 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  29.34 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  27.78 
 
 
326 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  27.83 
 
 
301 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  25.68 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  27.35 
 
 
326 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  27.78 
 
 
329 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.92 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
327 aa  85.1  1e-15  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.12 
 
 
323 aa  85.5  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.12 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.12 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.12 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  27.12 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.12 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.27 
 
 
323 aa  84  3e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  27.16 
 
 
321 aa  84.3  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.92 
 
 
321 aa  84.3  3e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.37 
 
 
304 aa  84  3e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  26.27 
 
 
370 aa  84  4e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  28.34 
 
 
323 aa  83.2  6e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  26.51 
 
 
323 aa  82  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  26.97 
 
 
317 aa  82  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  25.93 
 
 
321 aa  81.3  2e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.23 
 
 
325 aa  81.3  2e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.93 
 
 
321 aa  81.6  2e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.69 
 
 
323 aa  81.6  2e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  25.93 
 
 
321 aa  81.3  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  25.93 
 
 
321 aa  81.3  2e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  26.75 
 
 
322 aa  81.3  2e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  28.15 
 
 
323 aa  81.6  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  80.5  3e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  25.73 
 
 
341 aa  80.9  3e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  25.83 
 
 
344 aa  80.9  3e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  26.34 
 
 
321 aa  80.1  5e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  28.27 
 
 
335 aa  80.1  5e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 
341 aa  79.7  6e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.92 
 
 
322 aa  79.3  8e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  25.1 
 
 
323 aa  79.3  8e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  25.1 
 
 
322 aa  78.2  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  26.5 
 
 
322 aa  77.8  3e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.21 
 
 
331 aa  77.8  3e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.63 
 
 
336 aa  76.6  5e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  26.89 
 
 
322 aa  76.3  7e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  23.97 
 
 
320 aa  72  1e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  25.1 
 
 
332 aa  72  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 
349 aa  72.4  1e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.97 
 
 
328 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  23.44 
 
 
331 aa  71.2  3e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  26.41 
 
 
321 aa  70.9  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  30.81 
 
 
310 aa  71.2  3e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.75 
 
 
337 aa  70.5  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  23.9 
 
 
332 aa  70.5  4e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  26.72 
 
 
341 aa  70.1  5e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  25.3 
 
 
298 aa  70.1  5e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.22 
 
 
329 aa  69.7  6e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  26.86 
 
 
349 aa  69.7  6e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  29.34 
 
 
324 aa  69.7  7e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  25.78 
 
 
314 aa  68.6  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.39 
 
 
319 aa  68.2  2e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.42 
 
 
320 aa  68.2  2e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.05 
 
 
334 aa  68.6  2e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  25.3 
 
 
324 aa  68.2  2e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.98 
 
 
584 aa  67.8  3e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  29.92 
 
 
324 aa  67.4  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  25.91 
 
 
330 aa  64.7  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  26.07 
 
 
331 aa  63.9  3e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  24.03 
 
 
337 aa  63.9  4e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.46 
 
 
359 aa  63.2  5e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  26.58 
 
 
344 aa  63.2  6e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  25.51 
 
 
640 aa  62.8  8e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  23.08 
 
 
334 aa  62.4  1e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  24.78 
 
 
320 aa  61.2  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.81 
 
 
333 aa  61.6  2e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  21.67 
 
 
322 aa  61.2  2e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.53 
 
 
327 aa  60.8  3e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.65 
 
 
347 aa  60.5  4e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>