More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1965 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
270 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1896  hypothetical protein  48.82 
 
 
258 aa  245  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000620774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  35.85 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  35.38 
 
 
258 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0033  hypothetical protein  30.45 
 
 
258 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000645659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 
263 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 
263 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  34.56 
 
 
250 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  36.15 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30.23 
 
 
377 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.48 
 
 
364 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
377 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
244 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.08 
 
 
256 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 
264 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.02 
 
 
266 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.24 
 
 
249 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.37 
 
 
376 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  34.42 
 
 
265 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.66 
 
 
255 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  33.01 
 
 
263 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.46 
 
 
377 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.35 
 
 
382 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  31.71 
 
 
393 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.4 
 
 
261 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.65 
 
 
388 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  31.78 
 
 
248 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  33.02 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  35.53 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  27.96 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  29.2 
 
 
374 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  29.2 
 
 
374 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  31.52 
 
 
372 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  34.63 
 
 
384 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.19 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.21 
 
 
382 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  31.73 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  27.67 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  30.67 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  32.21 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  31.09 
 
 
378 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  31.5 
 
 
375 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  32.21 
 
 
382 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  28.95 
 
 
383 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  31.73 
 
 
378 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 
376 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  31.88 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.17 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  34.62 
 
 
385 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  31.55 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  28.22 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  28.7 
 
 
263 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  30.99 
 
 
344 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  30.43 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  32.86 
 
 
365 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  32.37 
 
 
394 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.11 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  28.96 
 
 
413 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  31.6 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  34.88 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  27.78 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  30.88 
 
 
382 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  26.92 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  29.3 
 
 
257 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  32.57 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  29.56 
 
 
375 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  29.85 
 
 
380 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  29.38 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  28.84 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  31.94 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  35.26 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  30.24 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  30.58 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  35.48 
 
 
384 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  32.84 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  35.03 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  28.08 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  29.55 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 
383 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  28.96 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  31.36 
 
 
381 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.7 
 
 
369 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  31.07 
 
 
383 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  30.58 
 
 
370 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  26.7 
 
 
369 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  29.73 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.84 
 
 
377 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  31.31 
 
 
383 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  33.04 
 
 
379 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>