149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1170 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
368 aa  717    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.83 
 
 
354 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  38.54 
 
 
371 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.03 
 
 
371 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  38.55 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1576  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.63 
 
 
373 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  29.01 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.01 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.14 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.24 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  24.65 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  24.02 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  24.02 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  23.74 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.46 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  23.74 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.28 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.65 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.92 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.36 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.63 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  22.28 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  22.28 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  23.82 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.8 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.2 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  25.27 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.6 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  25.41 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.98 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  26.63 
 
 
404 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  26.69 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.61 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.67 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.38 
 
 
423 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.14 
 
 
176 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.7 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.51 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.23 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.94 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.72 
 
 
412 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  25.48 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.39 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 
215 aa  59.3  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.93 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.92 
 
 
180 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  24.93 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  26.67 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.63 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  31.54 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1068  hypothetical protein  29.23 
 
 
413 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.71 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.11 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.62 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  27.75 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  34.91 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.88 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0677  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.82 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 
183 aa  54.3  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  22.37 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.14 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  32.2 
 
 
415 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  27.95 
 
 
173 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.11 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.38 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  34.29 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.86 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.67 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  26.42 
 
 
371 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.27 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  22.44 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  21.97 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  25.73 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  31.25 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.81 
 
 
216 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  36.26 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  33.06 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  25.68 
 
 
403 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  28.14 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  27.27 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.73 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.29 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  35.16 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.05 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.69 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  28.32 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  25.29 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  28.15 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  28.15 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  32.65 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  28.15 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  28.15 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  28.32 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  25.69 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  25.69 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>