More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2129 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  48.16 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  44.73 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.29 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  45.28 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  44.57 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  40.44 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.71 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.81 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  43.31 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.54 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  38.27 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.12 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.37 
 
 		 350 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  41.21 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.67 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  35.48 
 
 		 356 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>