152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2024 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  60 
 
 		 665 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  60 
 
 		 665 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  59.84 
 
 		 665 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  57.78 
 
 		 676 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  51.57 
 
 		 651 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  100 
 
 		 675 aa  1329    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  59.97 
 
 		 672 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  52.81 
 
 		 687 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  47.93 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  43.57 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  43.95 
 
 		 646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  43.91 
 
 		 641 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  43.91 
 
 		 641 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  43.43 
 
 		 637 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  41.51 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.22 
 
 		 664 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  42.2 
 
 		 678 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  40.48 
 
 		 681 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  42.79 
 
 		 632 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  41.44 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.03 
 
 		 731 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  41.19 
 
 		 651 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  39.44 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  36.06 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  37.36 
 
 		 718 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  41.51 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  38.44 
 
 		 722 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  39.1 
 
 		 697 aa  366  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  35.66 
 
 		 718 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  45.09 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  38.03 
 
 		 631 aa  362  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.84 
 
 		 736 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  41.64 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  35.89 
 
 		 752 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  38.77 
 
 		 719 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  37.03 
 
 		 708 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.34 
 
 		 687 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  35.16 
 
 		 671 aa  304  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  38.67 
 
 		 711 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.21 
 
 		 683 aa  296  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  44.51 
 
 		 654 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.66 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  46.83 
 
 		 319 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  39.66 
 
 		 310 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.74 
 
 		 319 aa  208  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  37.79 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.19 
 
 		 651 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  37.92 
 
 		 322 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  35.82 
 
 		 322 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  35.42 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  35.07 
 
 		 331 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  35.07 
 
 		 331 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  35.42 
 
 		 308 aa  157  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.19 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  35.66 
 
 		 322 aa  151  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.18 
 
 		 653 aa  144  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.64 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.9 
 
 		 394 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.77 
 
 		 354 aa  112  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.1 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  33.59 
 
 		 273 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  25.09 
 
 		 274 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  24.25 
 
 		 265 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  91.3  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.97 
 
 		 277 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.97 
 
 		 277 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  23.6 
 
 		 277 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.6 
 
 		 277 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  28.29 
 
 		 604 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.26 
 
 		 327 aa  89.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  31.42 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.14 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.44 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.1 
 
 		 246 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.99 
 
 		 315 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.41 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.93 
 
 		 296 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  25.89 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.27 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  29.41 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  29.18 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.05 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.18 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  29.35 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  35.19 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  26.38 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  28.86 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  29.35 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  29.35 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  26.09 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  24.73 
 
 		 290 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>