More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0193 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  57.2 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  57.2 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  56.83 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  54.28 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  53.87 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  53.82 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  50.92 
 
 		 273 aa  254  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  47.45 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.32 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  36.46 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  33.82 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  34.88 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  37.55 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  34.66 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  35.97 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  33.81 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  36.33 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  34.19 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.23 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  36.03 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.4 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.94 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.74 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  35.16 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  31.6 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.62 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  34.74 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  34.29 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.29 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.67 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  29.89 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  27.97 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.95 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.35 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.94 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  32.52 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.52 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.22 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.93 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1401  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.28 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.37 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  26.64 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.05 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  28.15 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.07 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  27.21 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  27.47 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  27.47 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.32 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.35 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  28.07 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  27.11 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  27.11 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.86 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  26.98 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.31 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  27.11 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  28.99 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.86 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.86 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  27.86 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  27.02 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  26.57 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.28 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.83 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.44 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.79 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.05 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  26.05 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.05 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.3 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.95 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.65 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>