More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3688 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 335 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  94.19 
 
 		 341 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  72.7 
 
 		 326 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  75.25 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  71.85 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  61.69 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  58.15 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  46.23 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  42.81 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.89 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  38.46 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.93 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.93 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  40.46 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  38.46 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.48 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  40.46 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.63 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  37.46 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.89 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.69 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.08 
 
 		 299 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.63 
 
 		 299 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.97 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.69 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.69 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  37.91 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 299 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.7 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  37.54 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  36.53 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.18 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.18 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  36.77 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.77 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  37.5 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  36.92 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  36.18 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  36.18 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  36.18 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  36.18 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  36.18 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  34.1 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  34.1 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  37.74 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.8 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.8 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.8 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.46 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  37.01 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>