More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3678 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  71.58 
 
 		 185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  73.22 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  69.4 
 
 		 190 aa  257  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  67.96 
 
 		 189 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  65.57 
 
 		 184 aa  244  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  56.7 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  57.46 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  55 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  53.93 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  53.11 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  51.38 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  51.38 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  50 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  55.8 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  48.6 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  48.6 
 
 		 196 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.75 
 
 		 180 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  46.93 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  46.07 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.35 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  45.86 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  44.38 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  43.82 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  43.79 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  46.93 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  43.24 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.81 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.39 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  47.78 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.57 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.77 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  40.91 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.81 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  39.55 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  45.81 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  45.81 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40 
 
 		 181 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  43.18 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.94 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.94 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  42.94 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  42.37 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  44.05 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  44.05 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.76 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.93 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.5 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  43.89 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.2 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.2 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.5 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.89 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.89 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.89 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.38 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  41.24 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  41.24 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  38.59 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.55 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.55 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.87 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  48.23 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>