More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0744 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  96.47 
 
 		 170 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  58.39 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  48.45 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  52.03 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.27 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2120  CheW protein  43.88 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.48 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.79 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  40 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.26 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.93 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.76 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  37.25 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.3 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.07 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  32.03 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.57 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  39.37 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.54 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.17 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.59 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.56 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  35.21 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.24 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.04 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  38.58 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.04 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  42.5 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.77 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.59 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  35.46 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  41.67 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  41.67 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.57 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  33.33 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.47 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  33.11 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  29.17 
 
 		 518 aa  95.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  33.1 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.94 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.94 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.94 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.48 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.33 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.77 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.77 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.25 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.14 
 
 		 218 aa  92  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  36.24 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  31.72 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.44 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  33.09 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  33.09 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  31.47 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.62 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.62 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.67 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.56 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.5 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.77 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  38.52 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.78 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.58 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.86 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  28.86 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.07 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  35.34 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.86 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  29.75 
 
 		 154 aa  87.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.37 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.89 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  32.14 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.2 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.08 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  34.06 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.65 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  32.35 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  34.15 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  26.67 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  31.94 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>