267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0054 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  100 
 
 		 335 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  89.94 
 
 		 308 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  56.07 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  41.01 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  41.01 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  36.08 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  39.54 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  39.54 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  39.01 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  41.95 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  37.33 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  37.41 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  40.7 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  35.47 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  35.4 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  34.81 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  33.33 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  36.63 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  33.48 
 
 		 1103 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  26.56 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  29.83 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  25.87 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.4 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.53 
 
 		 1247 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.92 
 
 		 591 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  27.83 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  27.83 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  27.83 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  28.24 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.2 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.26 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  36.63 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.92 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  26.96 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.33 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  35.64 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  26.96 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  27.83 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  35.64 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  37.63 
 
 		 466 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  27.7 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  34.65 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  35 
 
 		 775 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  34.65 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  24.14 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  27.39 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  27.39 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.17 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  27.39 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  27.39 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  26.73 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  37.5 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  27.39 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  27.39 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  25.5 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  28.34 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.31 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  31.52 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  35.42 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.74 
 
 		 1131 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  25.77 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  26.46 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  37.86 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  30.35 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.07 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30.93 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  25.25 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  25.95 
 
 		 598 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  24.26 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  34.62 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  29.74 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  26.71 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30.71 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  31.58 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  33.03 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  25.42 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  39.05 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  26.22 
 
 		 397 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  29.89 
 
 		 481 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  21.72 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  51.52 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  25.89 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.68 
 
 		 623 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  29.75 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  38.04 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  26.79 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  30.81 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.23 
 
 		 463 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  41.18 
 
 		 525 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.65 
 
 		 1147 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.58 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.95 
 
 		 1077 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  37.37 
 
 		 468 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>