84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2523 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  62.64 
 
 
189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  43.96 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  43.96 
 
 
182 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  43.41 
 
 
182 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  43.96 
 
 
182 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  43.96 
 
 
182 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  43.96 
 
 
182 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  43.41 
 
 
182 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  43.41 
 
 
182 aa  141  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  43.96 
 
 
182 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  39.19 
 
 
223 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1816  DedA family membrane protein  35.86 
 
 
167 aa  97.8  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.106663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.18 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.95 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.4 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  26.71 
 
 
197 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  26.71 
 
 
197 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.28 
 
 
251 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  28.88 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  23.3 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  30.83 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  54.7  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  32.14 
 
 
717 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 
746 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 
732 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.12 
 
 
732 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.12 
 
 
732 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  30.6 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.19 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.19 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25.2 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.11 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  23.57 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  28.46 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  28.12 
 
 
207 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.13 
 
 
713 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.68 
 
 
207 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.68 
 
 
213 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.63 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.4 
 
 
713 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  29.05 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.37 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 
246 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 
258 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  23.98 
 
 
227 aa  45.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  26.75 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  25.95 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.21 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  29.06 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  26.19 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  24.6 
 
 
714 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  27.1 
 
 
252 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  30.95 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  27.66 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  22.54 
 
 
226 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  22.64 
 
 
254 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  28.45 
 
 
232 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  25.41 
 
 
238 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  26.95 
 
 
238 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  23.21 
 
 
224 aa  40.8  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>