More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1767 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  100 
 
 		 414 aa  860    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  67.58 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  53.06 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  52.93 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  52.81 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  52.81 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  52.81 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  52.93 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  52.81 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  52.81 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  52.42 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  52.55 
 
 		 412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  51.53 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.98 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  41.53 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  38.74 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  38.61 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  39.5 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  40.99 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  39 
 
 		 410 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  38.96 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  39.94 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.39 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.38 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.88 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  36.1 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  36.54 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  35.48 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  37.01 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.29 
 
 		 430 aa  226  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  37.25 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  35.41 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  38.42 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  36.97 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.58 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  37.25 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  35.38 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  39.68 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.88 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.18 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.96 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.03 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  36.92 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.09 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.09 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.17 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  35.19 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  33.52 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.39 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  34.55 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  34.01 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  34.36 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 408 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  32.49 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.5 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.21 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.98 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  35.88 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 481 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  34.63 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  36.57 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  37.36 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>