More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0014 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  85.61 
 
 
424 aa  754  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  78.77 
 
 
424 aa  716  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  78.77 
 
 
424 aa  716  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  78.77 
 
 
424 aa  714  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  71.23 
 
 
424 aa  647  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  78.54 
 
 
424 aa  716  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  79.48 
 
 
424 aa  713  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
424 aa  870  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  79.01 
 
 
424 aa  717  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  68.79 
 
 
424 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 
420 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  67.92 
 
 
422 aa  602  1e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  67.92 
 
 
427 aa  601  1e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  2.14163e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
423 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  68.87 
 
 
423 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 
422 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  65.09 
 
 
423 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  67.46 
 
 
421 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  67.85 
 
 
423 aa  583  1e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  64.78 
 
 
423 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
427 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
422 aa  575  1e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 
422 aa  575  1e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
422 aa  577  1e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  64.3 
 
 
425 aa  574  1e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
422 aa  572  1e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  65.09 
 
 
427 aa  573  1e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  64.54 
 
 
425 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
425 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
425 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  62.03 
 
 
425 aa  551  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  62.17 
 
 
423 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  61.94 
 
 
422 aa  545  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.1419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  61 
 
 
428 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 
423 aa  542  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
424 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 
425 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
423 aa  539  1e-152  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 
426 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 
432 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  59.2 
 
 
423 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
428 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
428 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
427 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
427 aa  525  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
425 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
425 aa  524  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
423 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
422 aa  519  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
426 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.08686e-07  hitchhiker  6.59657e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  58.85 
 
 
417 aa  510  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
424 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
427 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
430 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 
427 aa  494  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
427 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
435 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.7376e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
428 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
427 aa  494  1e-138  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
428 aa  492  1e-138  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
425 aa  494  1e-138  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
428 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
436 aa  490  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
424 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
428 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
427 aa  487  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  57.72 
 
 
426 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
428 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.08788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
426 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
430 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
428 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
428 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.45216e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
428 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.18192e-05  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
424 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
426 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
426 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
429 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
425 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
424 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
438 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
434 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 
435 aa  481  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
433 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
421 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
438 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
433 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
428 aa  474  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  2.0455e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
421 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  5.82933e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
431 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
424 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>