More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2628 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  100 
 
 		 273 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  62.64 
 
 		 272 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  49.25 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  45.11 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  38.58 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  44.53 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  32.31 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  34.36 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  31.29 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  32.47 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.47 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  32.47 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  32.47 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  31.6 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3732  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.53 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  33.21 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  32.1 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.41 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  32.47 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  33.33 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  27.78 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.23 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  28.17 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  31.6 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  30.68 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  26.98 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  26.98 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  26.98 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  29.8 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  26.98 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  26.98 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  26.77 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  30.53 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  26.77 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  30.15 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  28.57 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  32.46 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  29.39 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  31.91 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 334 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  31.9 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  31.9 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  29.84 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  29.69 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  29.96 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.96 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.65 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  36.36 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>