195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0409 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  72.28 
 
 		 101 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  69.7 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  63.37 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  57.58 
 
 		 99 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  57.45 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.38 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.62 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  45.45 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  42.31 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  40.38 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.74 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.41 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  38.71 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.35 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.76 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.29 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.62 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.27 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.35 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.76 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.68 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.82 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.92 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.98 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  40.23 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.68 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  44.12 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  44 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  42.53 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  30 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  35.82 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  44.29 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.5 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.86 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.48 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.58 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.27 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.38 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.03 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.56 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.03 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.03 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  34.85 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  39.53 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.56 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.75 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.89 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.21 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.24 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.24 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.95 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  61.11 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  31.03 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.1 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  49.15 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  37.86 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  31.03 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.71 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.44 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  39.53 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  38 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  35.48 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  38 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  35.56 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  38 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  29.21 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  38.37 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.16 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.24 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>