More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0116 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  100 
 
 		 317 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  90.55 
 
 		 322 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  71.02 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.28 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  72.32 
 
 		 319 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  68.59 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  66.56 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.02 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.56 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.02 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.18 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  41.15 
 
 		 850 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  49.32 
 
 		 655 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 791 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  46.75 
 
 		 656 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.71 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  40.7 
 
 		 656 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  38.87 
 
 		 851 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  40.74 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 858 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  40.33 
 
 		 850 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  40.74 
 
 		 850 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  40.74 
 
 		 850 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  39.09 
 
 		 851 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  40.33 
 
 		 850 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  36.76 
 
 		 713 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  36.76 
 
 		 713 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.35 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  36.76 
 
 		 713 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  38.89 
 
 		 778 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.61 
 
 		 679 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.68 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.68 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  39.51 
 
 		 851 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.5 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 		 713 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  40.98 
 
 		 851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 		 713 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  40.98 
 
 		 851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 		 713 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  40.98 
 
 		 851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 637 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 778 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 		 852 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 760 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.02 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.51 
 
 		 645 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  42.93 
 
 		 752 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  38.29 
 
 		 687 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  42.36 
 
 		 755 aa  145  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 714 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 		 755 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  38.62 
 
 		 852 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.99 
 
 		 431 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  37.95 
 
 		 705 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  39.02 
 
 		 759 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.59 
 
 		 710 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 824 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  39.55 
 
 		 765 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 		 655 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.05 
 
 		 707 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  38.91 
 
 		 771 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.42 
 
 		 646 aa  142  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  44.28 
 
 		 730 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  37.38 
 
 		 749 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 641 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  35.29 
 
 		 791 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  41.63 
 
 		 762 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 654 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.5 
 
 		 704 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.56 
 
 		 830 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.98 
 
 		 642 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 		 751 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  38.02 
 
 		 848 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.78 
 
 		 792 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.25 
 
 		 656 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.94 
 
 		 744 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 		 814 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  43.65 
 
 		 681 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 709 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  39.09 
 
 		 709 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  40.35 
 
 		 673 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  40.35 
 
 		 680 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  40.35 
 
 		 673 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 844 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  40.45 
 
 		 833 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  36.61 
 
 		 709 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 844 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  36.89 
 
 		 819 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  37.45 
 
 		 844 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 		 796 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 709 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>