More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0062 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
328 aa  669  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83207e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  95.09 
 
 
319 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  67.28 
 
 
317 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 
317 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  67.73 
 
 
307 aa  417  1e-115  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  73.38 
 
 
322 aa  417  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  67.31 
 
 
315 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  51.08 
 
 
307 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 
307 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 
307 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.01 
 
 
301 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.74 
 
 
248 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.95 
 
 
298 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  40.29 
 
 
704 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.57 
 
 
431 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 
655 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  47.97 
 
 
655 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 
791 aa  148  1e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  45.14 
 
 
755 aa  148  1e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0045  glycosyl transferase family 51  40.99 
 
 
719 aa  148  1e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.44 
 
 
236 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.56 
 
 
230 aa  147  4e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  46.62 
 
 
656 aa  145  8e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  46.62 
 
 
656 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.73 
 
 
679 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 
850 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  40.21 
 
 
749 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 
850 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.3 
 
 
303 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
850 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  37.29 
 
 
850 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  37.29 
 
 
850 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  37.29 
 
 
850 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  37.29 
 
 
850 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  37.71 
 
 
858 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  37.29 
 
 
850 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 
850 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 
850 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 
291 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  37.29 
 
 
850 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  38.49 
 
 
705 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  38.31 
 
 
850 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  39.17 
 
 
744 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 
850 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  42.51 
 
 
706 aa  141  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  39.13 
 
 
759 aa  141  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  40.74 
 
 
762 aa  141  2e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  36.51 
 
 
851 aa  141  2e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
746 aa  141  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  35.74 
 
 
897 aa  141  2e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  37.1 
 
 
851 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 
914 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  39.55 
 
 
851 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  42.11 
 
 
791 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  140  4e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  38.08 
 
 
705 aa  140  4e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.6 
 
 
303 aa  140  4e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  140  4e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  140  4e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  140  4e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  39.11 
 
 
912 aa  139  5e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.05 
 
 
230 aa  139  5e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 
662 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.42 
 
 
656 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.71 
 
 
760 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 
824 aa  139  8e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 
751 aa  139  8e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  34.94 
 
 
868 aa  139  9e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  139  9e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  37.66 
 
 
705 aa  139  9e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  43.43 
 
 
752 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.13 
 
 
705 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  43.5 
 
 
817 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  36.56 
 
 
778 aa  137  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  39.17 
 
 
851 aa  137  3e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  39.17 
 
 
851 aa  137  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  39.17 
 
 
851 aa  137  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  41.58 
 
 
792 aa  137  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.58 
 
 
824 aa  137  3e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  41.62 
 
 
709 aa  137  3e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
765 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  37.1 
 
 
687 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  38.54 
 
 
645 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  41.24 
 
 
746 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.19 
 
 
640 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
637 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  43.43 
 
 
730 aa  136  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.13999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  38.61 
 
 
814 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  47.68 
 
 
320 aa  136  6e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  41.05 
 
 
778 aa  135  6e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 
821 aa  135  6e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.12 
 
 
275 aa  136  6e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  39.06 
 
 
667 aa  136  6e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 
701 aa  135  7e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  33.89 
 
 
712 aa  135  1e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  34.09 
 
 
905 aa  135  1e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 
837 aa  135  1e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.04 
 
 
641 aa  135  1e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  36.65 
 
 
852 aa  135  1e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  34.17 
 
 
638 aa  134  1e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>