More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7228 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 374 aa  757    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  86.9 
 
 		 374 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  70.93 
 
 		 375 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  72.12 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  69.92 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 		 373 aa  531  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  71.54 
 
 		 369 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  68.56 
 
 		 370 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  68.8 
 
 		 376 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  65.86 
 
 		 376 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  66.4 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  68.55 
 
 		 376 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  65.97 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  67.48 
 
 		 370 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  65.41 
 
 		 374 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  66.94 
 
 		 375 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  66.49 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  66.76 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  65.07 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  64.88 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 		 376 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  61.07 
 
 		 376 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  66.76 
 
 		 372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  67.56 
 
 		 374 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  64.15 
 
 		 378 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  65.41 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  65.41 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  65.41 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  59.24 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  59.95 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  63.96 
 
 		 385 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  61.17 
 
 		 379 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  60.98 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  60.27 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  58.93 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  55.47 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  44.84 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  31.01 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  29.04 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  28.26 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  28.94 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  29.53 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  25.35 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  28.41 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  28.87 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  28.07 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25.71 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  27.2 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  27.89 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  25.14 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.2 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  28.06 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  27.81 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  28.35 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.81 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  26.55 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  26.32 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  29.05 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  26.63 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  23.76 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  25.07 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  28.42 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.74 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  25.9 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.52 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  25.65 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  25.54 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  27.32 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  28.88 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  25.6 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  25.6 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  25.65 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  24.85 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  25.52 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  27.46 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  25.39 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  26.13 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  25.2 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  23.97 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  26.94 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  26.94 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  26.79 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  24.4 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  26.11 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  23.9 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  27.79 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.285129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>