More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4141 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  71.16 
 
 		 275 aa  377  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  67.62 
 
 		 274 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  63.67 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  61.4 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  50.4 
 
 		 495 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  47.75 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  32.16 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  41.61 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  28.51 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.53 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.04 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  30.46 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.85 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.52 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30.94 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  34.92 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  26.35 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  26.35 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  24.05 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  26.35 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  35.54 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  35.51 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  25.68 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  25.68 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.89 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  44 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  35.04 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  34.85 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.18 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  32.93 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.2 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.87 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.6 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  22.01 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  30.94 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.96 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.78 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.63 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  37.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.52 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  25 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>