56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3686 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  44.94 
 
 
184 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  41.48 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  39.18 
 
 
185 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  38.51 
 
 
185 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  38.2 
 
 
185 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  37.71 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  37.71 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  37.71 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  37.28 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  41.22 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  33.72 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  38.64 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34.04 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  32.94 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  34.48 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  33.13 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  35.16 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  30.36 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  31.94 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  33.83 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32.3 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.76 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  37.21 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  32.52 
 
 
172 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  32.85 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.6 
 
 
139 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  26.38 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.66 
 
 
135 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.06 
 
 
145 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.97 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  35.87 
 
 
143 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  30.72 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  26.98 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  31.75 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  29.69 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.55 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.6 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  31.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  31.34 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  28.24 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  25.9 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  27.5 
 
 
134 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.17 
 
 
160 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.46 
 
 
150 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>