More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1819 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  80.05 
 
 
376 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  67.47 
 
 
376 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  67.47 
 
 
399 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  69.35 
 
 
374 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  62.3 
 
 
375 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  62.3 
 
 
375 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  63.94 
 
 
379 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  62.3 
 
 
375 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  63.51 
 
 
377 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  63.78 
 
 
376 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  60.11 
 
 
388 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  55.15 
 
 
390 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  59.19 
 
 
374 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  60.74 
 
 
382 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  59.41 
 
 
376 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  58.76 
 
 
374 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  56.84 
 
 
374 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  61.54 
 
 
378 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  57.82 
 
 
385 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  57.61 
 
 
370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  55.44 
 
 
384 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
423 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  48.53 
 
 
374 aa  308  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  53 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  51.76 
 
 
422 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  53.89 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  47.08 
 
 
377 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
386 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
381 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  31.84 
 
 
383 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
384 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
770 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
414 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.75 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
370 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
419 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.84 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  34.35 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
810 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 
770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  28.17 
 
 
380 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
380 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  27.84 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
395 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.43 
 
 
382 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
373 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
424 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
410 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
381 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
387 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
406 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
406 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
395 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
377 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
414 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  29.92 
 
 
382 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
415 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.83 
 
 
377 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  29.92 
 
 
382 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
519 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
377 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
377 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 
422 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.27 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
409 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
378 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
376 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
536 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.89 
 
 
400 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
380 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
408 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
377 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 
365 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
435 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.68 
 
 
404 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.58 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
426 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.84 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.61 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>