198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1328 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  56.43 
 
 		 291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  54.26 
 
 		 285 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  48.73 
 
 		 283 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  43.16 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  47.64 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  43.88 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  41.64 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  43.11 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  43.46 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  45.52 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  43.01 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  52.84 
 
 		 212 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.16 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  40.94 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.89 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  37.86 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  37.91 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  38.13 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  40.93 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  36.68 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  36.93 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  40.67 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  39.79 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  34.97 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.62 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  38.79 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  36.1 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  37.98 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  38.79 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  36.65 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  37.37 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  36.1 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  36.88 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  38.01 
 
 		 301 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.63 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  38.49 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  39.26 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.01 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  35.13 
 
 		 296 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  36.47 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  32.25 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.63 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.41 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  35.23 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  35.77 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  35.23 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  34.89 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  37.01 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  36.43 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  33.56 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  33.45 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  34.51 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  34.22 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  32.85 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  32.25 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  35.07 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  32.5 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  36.43 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  31.32 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  34.04 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 326 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  35.66 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>