More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0025 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
353 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.89 
 
 
354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.75 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.93 
 
 
323 aa  288  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 
472 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.21 
 
 
338 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 
330 aa  209  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.39 
 
 
340 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.49 
 
 
366 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  28.34 
 
 
365 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 
366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
330 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.53 
 
 
353 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  26 
 
 
343 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
443 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  26.32 
 
 
356 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.71 
 
 
342 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
273 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  31.16 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  30.37 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  26.99 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  29.48 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  33.85 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  33.33 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  34.54 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  33.02 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.11 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  28.44 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.35 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  32.42 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  29.61 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  28.64 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  24.07 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
253 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  30.14 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  27.15 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  26.29 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  28.85 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  30.7 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  28.5 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.54 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  27 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 
253 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.96 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.18 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.24 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  32.73 
 
 
409 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 
270 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.96 
 
 
265 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  27.52 
 
 
273 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 
273 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>