188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3949 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 371 aa  749    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  75.82 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  32.66 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  36.81 
 
 		 399 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  40.76 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  35 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.9 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  44.83 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 418 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  30.99 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.01 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 956 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  34.62 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  33.53 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 1340 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  42.76 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 414 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.3 
 
 		 1119 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  40.15 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  29.59 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  29.19 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.79 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.73 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  29.24 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  23.53 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.93 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.93 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  36.13 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 1106 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.33 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 691 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  27.38 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  27.81 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  36.49 
 
 		 1837 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  29.2 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 703 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  28.16 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  25.6 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>