More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3098 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 376 aa  745    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  80.05 
 
 		 373 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  64.19 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  63.66 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  63.27 
 
 		 374 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  62.43 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  62.97 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  60.43 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  60.43 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  60.43 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  54.23 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  59.15 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  57.33 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  55.76 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  57.03 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  56.64 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  54.69 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  55.97 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  54.16 
 
 		 376 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  53.81 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  56.5 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  54.19 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  48.79 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  47.31 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  52.71 
 
 		 396 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  50.67 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  43.88 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  32.23 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 770 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.22 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 770 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  35.78 
 
 		 378 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  37.14 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  30.86 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.24 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 424 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  36.28 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.48 
 
 		 536 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.68 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  40.74 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 422 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>