More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0458 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  100 
 
 		 317 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  87.94 
 
 		 317 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  65.38 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  63.26 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  65.38 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  60.13 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  62.38 
 
 		 311 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  61.22 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  59.22 
 
 		 317 aa  351  8e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  59.87 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  59.11 
 
 		 325 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  57.28 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  57.51 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  55.99 
 
 		 309 aa  328  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  52.53 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  53.48 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  52.23 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.91 
 
 		 327 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  58.1 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  53.29 
 
 		 320 aa  289  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  48.88 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.07 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  42.66 
 
 		 344 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  43.39 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  42.66 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  45.55 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 343 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  42.71 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  41.39 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.62 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.33 
 
 		 349 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  42.54 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  42.07 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.62 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  39.09 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  38.61 
 
 		 339 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.86 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  43.28 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  38.01 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.65 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  43.69 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  43.62 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.2 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.67 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.53 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  43.52 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.13 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  40.95 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.1 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.64 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.08 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.27 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2963  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.947943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.55 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  42.96 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  41.36 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 358 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  42.96 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.02 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  42.96 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  37.19 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  40.87 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.51 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  39.33 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  38.41 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  38.51 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  41.64 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  40.63 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  42.62 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>