49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0088 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  48.94 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  39.04 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  39.01 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  37.86 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  34.56 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  36.05 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  37.96 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  34.53 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  43.75 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  36.03 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  37.06 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  28.91 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  32.35 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  29.1 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  31.62 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  29.92 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  27.64 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  29.66 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  28.23 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  31.09 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  25.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1464  hypothetical protein  34.88 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  25.42 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  23.14 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  23.28 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  23.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  23.14 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  23.44 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  23.21 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  24.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  28.45 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  28.45 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  24.37 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  24.37 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  28.68 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  40.82 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  27.59 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  27.59 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  27.59 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  31.51 
 
 		 105 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  35.14 
 
 		 105 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  31.51 
 
 		 105 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>