More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3617 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  100 
 
 
220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  73.85 
 
 
220 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  73.85 
 
 
220 aa  332  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  73.85 
 
 
220 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  65.74 
 
 
232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  64.81 
 
 
222 aa  295  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  67.59 
 
 
222 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0478  DNA-binding transcriptional regulator BasR  76.61 
 
 
220 aa  284  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000375321  normal  0.853043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  66.67 
 
 
222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.94 
 
 
222 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.94 
 
 
222 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.94 
 
 
222 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.94 
 
 
222 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.94 
 
 
222 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.48 
 
 
222 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  55.45 
 
 
222 aa  248  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 
220 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 
220 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 
220 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
222 aa  204  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  48.13 
 
 
221 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.66 
 
 
218 aa  201  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.98 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 
221 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.91 
 
 
219 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 
220 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.91 
 
 
219 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.52 
 
 
219 aa  198  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.91 
 
 
219 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.91 
 
 
219 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.91 
 
 
219 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
220 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  46.51 
 
 
224 aa  198  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.52 
 
 
219 aa  197  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  50.75 
 
 
225 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  50.75 
 
 
225 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  46.05 
 
 
224 aa  197  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  43.52 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.52 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.52 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  43.52 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.52 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.44 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3990  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.300119  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.12 
 
 
218 aa  194  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  46.54 
 
 
218 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.76 
 
 
224 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
225 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 
230 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
235 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 
223 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 
222 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 
220 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 
220 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
225 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 
227 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
220 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 
224 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
223 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 
220 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
227 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3490  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 
215 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 
224 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 
221 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
219 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
227 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 
225 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  44.84 
 
 
246 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  42.73 
 
 
225 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
225 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
220 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
255 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
225 aa  187  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>