More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0378 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.24 
 
 
470 aa  893  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.28678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  93.35 
 
 
467 aa  881  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  100 
 
 
469 aa  939  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.60112e-05  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  76.27 
 
 
468 aa  706  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.06 
 
 
467 aa  873  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.07821e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  81.25 
 
 
474 aa  748  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  75.11 
 
 
473 aa  697  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  72.44 
 
 
474 aa  669  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  81.25 
 
 
471 aa  747  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  70.55 
 
 
482 aa  654  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  75 
 
 
468 aa  701  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.71149e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.28 
 
 
467 aa  895  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.62617e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.24 
 
 
469 aa  894  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.24 
 
 
469 aa  894  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  77.47 
 
 
470 aa  731  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  77.59 
 
 
470 aa  729  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  75.86 
 
 
469 aa  685  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  74.89 
 
 
473 aa  677  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  85.19 
 
 
466 aa  790  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.55253e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  70 
 
 
487 aa  651  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.67 
 
 
470 aa  895  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  93.35 
 
 
467 aa  881  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.24 
 
 
469 aa  894  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  74.78 
 
 
468 aa  699  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  81.25 
 
 
471 aa  747  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  69.57 
 
 
457 aa  618  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  66.59 
 
 
503 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  62.99 
 
 
467 aa  604  1e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  65.57 
 
 
502 aa  603  1e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  63.88 
 
 
473 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  60.87 
 
 
466 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  65.78 
 
 
513 aa  583  1e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04173  D-alanine/D-serine/glycine permease  68.78 
 
 
440 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3611  amino acid permease-associated region  63.84 
 
 
493 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11719  D-serine/alanine/glycine transporter protein cycA  59.26 
 
 
556 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.636709  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0056  amino acid permease family protein  59.48 
 
 
467 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0051  amino acid permease family protein  59.31 
 
 
467 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  54.01 
 
 
472 aa  494  1e-138  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  53.85 
 
 
452 aa  491  1e-138  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2472  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 
485 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  53.33 
 
 
453 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  53.33 
 
 
453 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  55.88 
 
 
467 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  51.74 
 
 
469 aa  466  1e-130  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  51.74 
 
 
469 aa  466  1e-130  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  51.03 
 
 
458 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  49.43 
 
 
459 aa  458  1e-128  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  45.81 
 
 
475 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  45.49 
 
 
449 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.48817e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 
464 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  45.29 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  45.27 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  45.27 
 
 
463 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.33182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  45.29 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94828e-06 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  45.29 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  46.53 
 
 
448 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  45.29 
 
 
463 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.4111e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  45.29 
 
 
463 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.7445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  46.71 
 
 
462 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  44.84 
 
 
463 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.95475e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  44.84 
 
 
463 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  6.38139e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  44.84 
 
 
463 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 
463 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66726e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  43.99 
 
 
461 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  44.84 
 
 
449 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.03198e-05  hitchhiker  4.6337e-07 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  43.99 
 
 
485 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  43.99 
 
 
447 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 
460 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 
460 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  43.99 
 
 
447 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  43.99 
 
 
447 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 
460 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  43.99 
 
 
461 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  43.31 
 
 
485 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  43.67 
 
 
459 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  43.58 
 
 
460 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  43.23 
 
 
462 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  43.89 
 
 
468 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  42.64 
 
 
457 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  42.73 
 
 
471 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  42.34 
 
 
468 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  42.73 
 
 
468 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  42.73 
 
 
468 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  40.57 
 
 
462 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.67644e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  42.73 
 
 
468 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  42.5 
 
 
468 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  42.5 
 
 
468 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  42.5 
 
 
468 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  42.5 
 
 
468 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  40.31 
 
 
467 aa  356  6e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  43.57 
 
 
452 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  41.16 
 
 
476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  39.7 
 
 
466 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  41.16 
 
 
476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  41.16 
 
 
476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>